As crianças/jovens podem ser referenciadas para uma intervenção do CAFAP, pelas Comissões de Proteção de Crianças e Jovens – CPCJ, pelo Tribunal, por entidades públicas ou privadas do âmbito da segurança social, saúde, educação, justiça, por qualquer cidadão e ainda pela própria família. O processo de admissão poderá ocorrer em qualquer altura do ano, desde que haja vaga, sendo que na inexistência da mesma, será mantida em lista de espera.